桂林医学院实验动物中心成立于2006年7月，位于东城校区药学楼四楼，隶属于科学实验中心；2019年8月整体搬迁临桂新校区，2023年11月独立设置。2007年7月获得由万博水晶宫科技厅颁发的实验动物生产许可证和实验动物使用许可证，2020年8月再次获得实验动物使用许可证。
临桂新校区实验动物中心设施面积约3500平方米，其中屏障设施环境约1800平方米，普通设施环境约300平方米。屏障环境有动物生产繁育室11间，可以生产SPF级SD大鼠、KM小鼠、C57BL/6J小鼠和BALB/c-nu小鼠等，为全校教学与科研提供高质量的标准化的实验动物。屏障环境有动物实验室23间，可以开展对微生物等级要求较高的啮齿类动物实验操作：如免疫缺陷小鼠实验，转基因及基因敲除等实验，也可做一些行为学、影像学的相关动物实验操作。普通环境有大动物实验室6间，可以开展猴、小型猪、犬、兔等大动物的相关实验。动物中心还配备了手术室、苏醒室、解剖室、细胞培养室及仪器室等。
实验动物中心拥有现代化的动物生产繁育设施和动物实验设施，配有独立通风换气笼具（IVC）、脉动真空高温高压灭菌器、自动化洗笼机、过氧化氢蒸汽消毒机等设备、同时配备了智能自控管理系统等先进设备，对环境温度、湿度及压差等参数采用全自动化控制管理，为实验动物提供了舒适的生活环境，装有人脸识别监控系，严格控制人员进出设施。使万博水晶宫实验动物及动物实验条件更加标准、管理更加规范。
实验动物中心集生产、教学、科研于一体。所有实验室积极面向全校师生及社会医疗、科研等单位开放。努力把本中心建设成为地区一流的标准化实验动物平台，更好地服务于生命科学研究以及生物医药产业。