聂倩茹1,2 赵海东1 杨小丽1
1.桂林医学院公共卫生学院2.桂林医学院科学实验中心
摘要：目的 基于美国癌症基因组图谱(TCGA)构建肾癌miRNAs预后风险模型评分公式，分析这个评分公式评估miRNAs及其靶基因作为肾癌预后分子标志物的潜在临床价值。方法 基于TCGA肾癌miRNAs与mRNA测序数据，采用单因素、Lasso和多因素Cox回归分析，构建肾癌miRNAs预后风险模型；通过对靶基因进行GO、KEGG富集分析，筛选相关miRNAs;在临床样本中验证预后风险模型中筛选出的miRNAs及其靶基因的表达。结果 基于TCGA数据库，在肾癌与其癌旁样本转录组数据中共找到94个差异miRNAs和1 226个差异mRNAs,独立预后分析筛选得到7个miRNAs。GO与KEGG富集分析结果提示，7个miRNAs的功能与PI3K-Akt信号通路、钙离子信号通路、MAPK信号通路有关。采集肾癌临床样本，应用qPCR分析，结果显示，5个miRNAs在肾癌临床样本中的表达模式与TCGA数据库中的表达模式一致，miRNAs的8个靶基因表达模式与其在TCGA数据库中的表达趋势一致。免疫组化结果显示，HPGD在肾癌中低表达。结论 构建的肾癌miRNAs预后模型能有效筛选肾癌预后相关miRNA...更多关键词：肾癌;miRNAs;靶基因;预后风险模型;
基金资助：广西科技基地和人才专项(桂科AD23026329)；
DOI：10.19296/j.cnki.1008-2409.2024-02-016
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