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基于生物信息数据分析C12ORF49在乳腺癌中的表达及其意义

【来源:《华夏医学》编辑部 | 作者:马强等 | 编辑:李佳睿 | 发布日期:2024-09-17】

马强 李慧娟 吕运成

桂林医学院—邵阳学院附属第一医院医学硕士专业学位研究生联合培养基地

摘要:目的 通过在线数据库分析12号染色体开放阅读框49(C12ORF49)在乳腺癌中的表达情况、临床意义及互作蛋白功能,为乳腺癌防治和预后预测提供新思路。方法 使用Oncomine数据库及人类蛋白质图谱(HPA)数据库分析C12ORF49基因和蛋白在乳腺癌不同组织中的表达差异性,然后应用Kaplan-Meier Plotter数据库分析C12ORF49表达水平与不同病理特征乳腺癌患者预后的相关性,最后利用STRING数据库绘制C12ORF49互相作用蛋白网络图,并通过KOBAS生物分析平台进行KEGG功能富集分析。结果 乳腺癌中C12ORF49的表达高于正常组织,乳腺癌C12ORF49 mRNA高表达患者的总生存时间(OS)及无远处转移生存时间(DMFS)更短,差异有统计学意义(P<0.05);C12ORF49可预测luminal B型乳腺癌患者的不良DMFS预后(P<0.05);C12ORF49对乳腺癌不良DMFS预后的影响可能独立于乳腺癌受体表达状态。C12ORF49可能通过NF-κB信号通路、TCR信号通路、血小板激活等生理过程(P<0.01, Corrected-...更多关键词:12号染色体开放阅读框49;乳腺癌;生物信息学;

基金资助:湖南省自然科学基金科教联合项目(2022JJ50194);湖南省教育厅科学研究项目(21C0597);邵阳市科技局科技创新指导性项目(2021042ZD);邵阳学院附属第一医院横向科研合作项目(2020HX04);

DOI:10.19296/j.cnki.1008-2409.2024-02-015

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