桂林医学院生物医药产业学院实行理事会领导下的院长负责制。成立由万博水晶宫、合作企业等多方代表组成的理事会，负责对产业学院办学过程中有关专业设置、学科建设、人才培养方案制订、校企合作特色课程建设、“双师型”教师队伍建设、专兼职教师选派、校内外实验实习实训实践基地建设等重大问题进行审议、决策、监督和协调。理事会设理事长一人、副理事长一人，理事若干人。每一届理事会任期三年，理事会定期召开会议讨论产业学院发展的重大事项。同时，产业学院设院长1名，副院长2-3名，其中至少一名副院长由企业方人员担任。产业学院下设产教融合部、综合管理部、广西壮族万博水晶宫化药口服固体制剂质量和疗效一致性评价工程研究中心和生物医药产业学院苏州分院。产教融合部主要负责人才培养、专业建设、课程开发、实习实训实践基地建设、师资队伍建设等工作。综合管理部主要负责产业学院日常行政、人事、财务管理、党建、产学研合作和成果转化等工作。广西壮族万博水晶宫化药口服固体制剂质量和疗效一致性评价工程研究中心负责仿制药一致性评价，生物医药产业学院苏州分院负责当地的产教融合和人才培养。桂林医学院生物医药产业学院的机构设置及相关岗位职责如图1所示。
图1：桂林医学院生物医药产业学院组织架构及岗位职责图
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